Nace en Valencia y en 1971 se traslada a Barcelona y estudia diseño gráfico en la Escuela Elisava. En 1973 cofunda el Rrollo Enmascarado, primer cómic underground en España. Inicia su andadura profesional con diversas exposiciones artísticas a finales de los 70. Publica en numerosas revistas y algún libro. Diseña el cartel Bar Cel Ona, que se convierte en uno de los iconos de la ciudad (Barcelona 1979).
En 1988 Cobi es elegido como mascota de los Juegos Olímpicos de Barcelona 92. Al año siguiente, Javier Mariscal funda el Estudio Mariscal en Palo Alto. Será el primer estudio creativo multidisciplinar del país.
En 1999 le dan el Premio Nacional de Diseño.
En 2010 se estrenó el largometraje de animación Chico y Rita que dirigió junto a Fernando Trueba, ganadora del Premio Goya y nominada a los Oscar como mejor película de animación. Tras muy diversos encargos y reconocimientos.